百合属耐贮藏的蔬菜，具有3个月的休眠期。百合性喜阴凉干燥，对温度适应范围较广，贮藏适温在0±0.5℃，在5―11℃也可。百合是无皮鳞茎，虽比有层干膜包裹的洋葱鳞茎等容易失水，但由于每瓣鳞片上都有内外衣包裹，可减少水分蒸发。所以，百合贮藏要求较低的湿度环境，相对湿度要求在75％―80％。百合不耐风吹，采后遇风吹则鳞片易变红、干缩。新掘起的鳞茎也不耐日晒，鳞片易变色、失水。

       一、层积贮藏法
　　选阴凉的室内或库内，砌一个埋藏坑或者使用筐（箱），在坑或筐（箱）底先铺一层经曝晒、晾干并筛除杂质的黄沙，厚约20厘米，然后按一层百合―层沙子的顺序进行摆放，顶部用沙子封顶，不让百合暴露在空气中。百合埋在沙子中，可起到自发气调的作用减少养分损失，并能保持一定的湿度。百合贮藏期间要防止堆内发热，贮藏中要每隔20―30天抽查1次，抽查时先翻查一小堆，如发现产品有问题再继续检查，如产品完好就再用沙覆盖好。如黄沙过湿时，要及时更换。贮藏期间保持5―11℃的库温，一般可贮藏至翌年3月。
　　二、薄膜袋贮藏法
　　将百合用0.03―0.04毫米厚的透湿薄膜袋密封包装，每袋4―5千克，再放入筐（箱）中或置于贮藏架上，贮藏期间的库温控制在0℃，相对湿度保持在65％―75％。采用该方法百合保藏时间长，重量损失较小，外观和品质均较好。用该法可贮到翌年春天。